Onde, em que, no qual: o que usar?

O termo onde deve empregar-se quando se está perante a referência a lugares. 

A universidade onde estudei é muito boa. 

No entanto, pode ser substituído por em que ou na qual: 

A universidade em que estudei é muito boa; A universidade na qual estudei é muito boa.

Nestes casos, a escolha deve recair sobre a melhor sonoridade. Ou seja, utiliza-se sempre onde para se referir a lugares, mas pode substituir-se por em que ou no qual, permanecendo a frase correta do ponto de vista gramatical e semântico.

O mesmo não acontece com em que e no qual, que devem ser aplicados em situações que não se referem a lugares. 

O processo em que tal foi referido foi arquivado; O contexto no qual isso foi dito era justificável.

Nestes casos não se deve utilizar o advérbio de lugar onde.